物理与电子工程学院始建于1958年。办学实力雄厚，教学质量突出，学术氛围浓郁，毕业生就业渠道顺畅。
师资力量雄厚。现有在职在编教师51人，教授6人、副教授16人、高级实验师1人，具有博士学位教师16人，硕士20人；享受国务院特殊津贴者1人，山东省有突出贡献的中青年专家1人，山东省教学名师2人，菏泽市专业技术拔尖人才2人，学校“5136”高层次人才二层次2人，三层次2人，四层次5人。
学科专业建设成绩突出。拥有省级重点学科（理论物理）、省级优秀教学团队（物理学主干课程）和省级特色专业（物理学）。设置物理学、电子信息科学与技术（含包括智能物联系统设计与应用、智能终端设计与开发和移动云通信方向）、电气工程及其自动化3个本科专业和应用电子技术、电子信息工程技术、电气自动化技术3个专科专业，在校生近1200人。
科研成果丰硕。近年来，在《中国科学》、《Phys.Lett.A》、《Opt.Lett.》等国内外权威刊物上发表研究论文300余篇，其中200余篇被SCI、EI收录。获山东省自然科学奖2项；山东省优秀教学成果奖4项；山东高校优秀科研成果5项；菏泽学院优秀科研成果一等奖10余项；获取国家专利7项。学科组成员主持参与国家自然科学基金研究项目5项，主持山东省自然科学基金研究项目5项，山东省教育厅科技计划项目3项，山东省高等学校实验技术研究课题1项，学校科研基金项目10余项。9门课程被评为省级精品课程，1门课程被评为省级一流课程（模拟电子技术），16门课程被评为校级精品课程。
教学改革扎实推进，人才培养质量不断提高。近三年来，毕业生考研率名列同类院校前茅。1人获全国大学生物理教学技能大赛特等奖、14人获一等奖、17人获二等奖，19人获山东省大学生物理教学技能大赛一等奖、24人获二等奖,；获全国大学生电子设计竞赛二等奖5项，山东赛区一等奖4项、二等奖6项；获第八届全国大学生嵌入式物联网大赛三等奖2项、山东赛区一等奖3项；获省大学生物理科技创新大赛一等奖8项、二等奖12项；获山东省第十二届“挑战杯”一等奖1项，二等奖1项；2篇本科生论文在重要学术刊物《大学物理》发表，多名学生获得国家专利。
加大实验仪器设备投入力度，教学条件明显改善。现有基础物理、电子电气技术、电子信息和近代物理四大实验室，20余个实验室分室。拥有网络教学平台、多媒体等现代化教学设备，仪器设备总值700余万元，实验室建筑面积5000多平方米。资料室藏书7000千余册，专业期刊杂志500余套。
校企合作成效显著，毕业生就业考研质量明显提高。先后与北京达内科技、青岛东和、烟台富士康、天津中环通讯、济宁惠普等知名企业签订了校企合作协议，其中，与达内科技联合成功举办了电子信息科学与技术专业（智能物联、智能终端和移动云通信方向），为学生实习、实训、就业拓宽了空间。学生考研率和就业率逐年提升。
